Pemerintahan

Kabupaten yang wilayahnya mengelilingi Danau Tigi ini ber-ibukota di Distrik Tigi. Bupatinya sekarang berkantor di kota Waghete, yang masuk wilayah Distrik Tigi. Kantor Bupati yang beralamat di Jl. Cendrawasih No. 01 Waghete, Tigi - Papua ini baru selesai dibangun pada tahun 2010, dibangun di atas tanah seluas 500 x 300 meter persegi, yang dibeli dari masyarakat setempat. Kota Waghete terletak dipinggir danau purba yang berada di Provinsi Papua, yakni danau Tigi.

Kabupaten Deiyai mempunyai dua lembaga didalam pemerintahannya, yaitu :

1. Lembaga Eksekutif

2. Lembaga Legislatif